Seine Aufgaben sieht das Archiv im Verwahren, Bearbeiten und Ordnen der laufenden Verwaltungsakten der zentralen Universitätsverwaltung (derzeit bis 1991), in der Sicherung von wissenschaftlichen Nachlässen Innsbrucker Gelehrter, in der Verwahrung und wissenschaftlichen Bearbeitung der historischen Aktenbestände der Universität Innsbruck und in der wissenschaftlichen Aufarbeitung der Innsbrucker Universitätsgeschichte.