Direktor / Museumsbeauftragter im Unstrut-Hainich Kreis: Thomas T. Müller M.A., Stellv. Direktor: Friedrich Staemmler M.A.
Kulturgeschichte: Thomas T. Müller M.A. Kulturgeschichte / Museumspädagogik: Steffi Maass M.A. Ur- u. Frühgeschichte / Kreisbodendenkmalpflege: Wulf Walther Ur- u. Frühgeschichte: Ingolf Schwedler Kunst: Friedrich Staemmler M.A.
Die Museen wurden 1879 als Gewerbezentrum gegründet und 1928 in ein Heimatmuseum umgewandelt. Im Jahr 1975 gelangte die Zentrale Gedenkstätte "Deutscher Bauernkrieg" hinzu, 1990 wurden die fünf Einzelmuseen zum Zweckverband Mühlhäuser Museen zusammengefasst
Periodikum: Mühlhäuser Beiträge. Schriftenreihe: Sonderhefte der Mühlhäuser Beiträge, Mühlhäuser Museumshefte. Museums- u. Sammlungsführer: Erlebnis Mühlhausen (Faltblatt-Prospekt der Mühlhäuser Museen), Mühlhausen 1991, Jürgen Winter: Aspekte Thüringer Kunst - Malerei und Graphik 1945 bis 1970 (Katalog), Mühlhausen 1989, Christa Richter: Die Marienkirche zu Mühlhausen (Die Thomas-Müntzer-Gedenkstätte Marienkirche zu Mühlhausen), Mühlhausen 1987 (Mühlhäuser Beiträge/Sonderh. 7), Gerald Patzelt: Die naturkundlichen Sammlungen des Mühlhäuser Heimatmuseums - Herkunft, Bestand, Perspektiven. In: Mühlhäuser Beiträge 7 (1984), S. 87-97, Udo Sareik: Die Kornmarktkirche zu Mühlhausen, Mühlhausen 1980 (Mühlhäuser Beiträge/Sonderh. 3),
Museen: Kulturhistorisches Museum, St. Marien - Müntzergedenkstätte, Bauernkriegsmuseum Kornmarktkirche, Thomas-Müntzer-Gedenkstätte (St. Marien), Historische Wehranlage, Museumsgalerie Allerheiligenkirche. Dauerausstellungen/Sammlungen: Stadtgeschichte Mühlhausens, Regionalgeschichte, Ur- u. Frühgeschichte (Kulturhistorisches Museum), Reformation u. Bauernkrieg (Bauernkriegsmuseum Kornmarktkirche), Müntzer-Gedenkstätte (St. Marien), Thüringer Kunst zwischen 1945 u. 1990 (Museumsgalerie Allerheiligenkirche)
Archäologisches Ortsakten-, Karten- u. Fotoarchiv, Präsenzbibliothek