Leiter: Dr. Jürgen Scheffler
Das mit dem Beinamen "Hexenbürgermeisterhaus" benannte, 1571 erbaute Bürgerhaus gilt als eines der bedeutendsten Baudenkmäler städtischer Architektur im Stil der Weserrenaissance. Seit 1911 befindet sich darin das Städtische Museum. Infolge umfangreicher Sanierungsmaßnahmen war das Museum von 1998 bis 2004 geschlossen. Im Mai 2004 erfolgte die Wiedereröffnung
Schriftenreihen: Schriften des Städtischen Museums Lemgo, Museums-Materialien.
Regina Fritsch/Jürgen Scheffler (Hg.): Karl Junker und das Junkerhaus. Kunst und Architektur in Lippe um 1900. Beiträge des Symposiums vom 21. März 1998, Bielefeld 2000 ( Schriften des Städtischen Museums Lemgo; 4), Jürgen Scheffler (Hg.): Stadt in der Geschichte - Geschichte in der Stadt. Dokumentation der stadtgeschichtlichen Ausstellung, Bielefeld 1990, Fred Kaspar: Das Hexenbürgermeisterhaus in Lemgo als Beispiel bürgerlichen Bauens und Wohnens zwischen dem 16. und 20. Jahrhundert, Bielefeld 1984
Dauerausstellung: Stadtgeschichte, regionale Kulturgeschichte, Handwerk u. Gewerbe, bürgerliche Wohnkultur, Geschichte der Hexenverfolgungen in Lemgo, Nachlass der Lemgoer Scharfrichterfamilie Clauss / Clausen, Asienforscher Engelbert Kämpfer (1651-1716).
Aussenstelle: Museum Junkerhaus Lemgo, Nachlass der Lemgoer Scharfrichterfamilie Clauss / Clausen