Die Bibliothek sammelt vor allem theologische Werke sowie Literatur über die Orden der katholischen Kirche (Monastica), sowie den Bereich der Aszetik und Mystik. Dazu kommen noch allgemeine katholische Zeitschriften und Buchreihen, sowie Werke über Philosophie, Politik, Literatur Human- und Naturwissenschaften, sowie Musik. Fächerübergreifend ist das Fach „Scholaria“ mit Schulbüchern und Schulzeitschriften, „Encyclopaedica“ mit älteren Enzyklopädien fächerübergreifenden Werken sowie Bücher zur Wissenschaftsgeschichte und „Miscellanea“ mit einzeln katalogisierte Kleinschriften und Sonderdrucken. Unter „Ettalensia“ werden Werke Ettaler Autoren und die Veröffentlichungen von Kloster, Schule und Internat gesammelt. Die Bibliothek des Byzantinischen Instituts Ettal ist als Spezialsammlung gesondert aufgestellt.